AI支持 中疾控病毒病所第一时间完成北京疫情病例样本全基因组测序

AI支持 中疾控病毒病所第一时间完成北京疫情病例样本全基因组测序

• 来源:网络
• 更新日期:2020-06-18

摘要： 原标题：AI支持 中疾控病毒病所第一时间完成北京疫情病例样本全基因组测序 北京新一轮疫情牵动着人们的心，病毒基因组测序分析工作尤为迫切。为支持

原标题：AI支持 中疾控病毒病所第一时间完成北京疫情病例样本全基因组测序

北京新一轮疫情牵动着人们的心，病毒基因组测序分析工作尤为迫切。为支持北京市疫情防控技术需要，中国疾控中心病毒病所应急技术中心在6月11日接收到北京市疾控中心送检4份病例标本后，马上开展核酸检测与基因组测序等应急支撑工作，6月12日第一时间完成相关病例样本病毒全基因组序列测定和分析工作，并及时报告给国家卫健委及北京市相关部门，为北京新冠肺炎疫情防控与病毒溯源提供重要科技支撑。

这次中国疾控中心迅速完成病毒全基因组序列测定和分析工作，“中国CDC应急技术中心-百度基因测序工作站”发挥了重要作用。中国疾控中心病毒病所应急技术中心主任谭文杰表示，基于团队前期建立优化的新冠全基因组测序技术方案，借助先进的测序仪，样本接收后10个小时即完成了北京四个样本的全基因组测序。这也是百度的AI大数据能力支持的“中国CDC应急技术中心-百度基因测序工作站”首战告捷。

为共同推动新冠肺炎病毒基因组分析与新型疫苗研究工作，今年4月，百度与中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所签署战略合作协议，双方联合设立“中国CDC应急技术中心-百度基因测序工作站”。同时，百度为该工作站配备了一整套先进的二代与三代测序设备平台，并协商制定了全面开展新冠肺炎相关研究的合作计划，基于百度研发的线性二级结构预测算法LinearFold、mRNA疫苗二级结构设计算法LinearDesign、Covseq新型冠状病毒分析溯源可视化平台等领先技术，助力新冠肺炎相关研究，并长期支持公共卫生相关科学研究。

目前，百度研究院研发的线性二级结构预测算法LinearFold已经陆续在各基因检测机构、防疫中心及全世界科学研究中心投入应用。LinearFold可将此次新型冠状病毒的全基因组二级结构预测从55分钟缩短至27秒，提速120倍，节省了两个数量级的等待时间，是RNA结构预测领域40年来第一次重大提速。1月30日，百度已向全球免费开放LinearFold算法及世界上现有最快的RNA结构预测网站，以提升新型冠状病毒RNA空间结构预测速度。

据悉，基于LinearFold算法，百度研究院5月推出全球首个mRNA疫苗基因序列设计算法LinearDesign，专门用于优化mRNA序列设计的高效算法。LinearDesign能在16分钟内大大提升mRNA疫苗设计的稳定性和蛋白质表达水平，大大加速疫苗研发速度。中国疾病预防控制中心后续将使用LinearDesign算法设计的mRNA疫苗序列进行体外实验，验证疫苗的稳定性和蛋白质表达效率。